60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1472 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  312  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.97 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  34.35 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  34.85 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  27.21 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  32.58 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  29.85 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0896  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  29.1 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  26.15 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  28.24 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  32.09 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  32.09 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  29.77 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  25 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  22.22 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  30.53 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  18.49 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  25 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  26.15 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  24.62 
 
 
111 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  26.24 
 
 
163 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  25.32 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  23.31 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  23.66 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  38.6 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  20.86 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  25.52 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  21.19 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  25.18 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  22.31 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  33 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  26.36 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  25.76 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  21.85 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  22.54 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  21.05 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.79 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  27.61 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  37.25 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.08 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  34.04 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  21.02 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  27.13 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  28.69 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  22.83 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  37.78 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.2 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  33.9 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  25.22 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  18.8 
 
 
151 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  22.3 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  24.06 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  26.12 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  21.52 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  22.79 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  20 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  32.14 
 
 
110 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>