More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1348 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  50.71 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.61 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.67 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.68 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.61 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.65 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.37 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.65 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.68 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.65 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.65 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.45 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.77 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.22 
 
 		 163 aa  84  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  32.24 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.45 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.45 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.79 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.5 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.08 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.5 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.97 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.15 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.5 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.5 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.5 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  34.97 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.99 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.03 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  28.67 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  29.37 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.4 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.4 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  33.83 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.58 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.61 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  27.45 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  34.59 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.25 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  31.33 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.06 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  31.39 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.43 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.08 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.19 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  25.62 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.71 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  24.22 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.17 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  28.36 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  33.09 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  28.36 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.36 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  29.71 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  26.99 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  27.33 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  27.61 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  29.41 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  32.12 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  30.36 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.17 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  29.2 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  31.65 
 
 		 238 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.43 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.58 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.59 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.67 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.09 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  28.89 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.34 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  25.19 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.48 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.58 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.48 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  27.4 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  27.63 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.67 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  29.91 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.81 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.37 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  27.86 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.09 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  26.53 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.34 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>