More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1339 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  100 
 
 
241 aa  485  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  34.51 
 
 
246 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.19 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  29.28 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.38 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  29.17 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.64 
 
 
271 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  22.12 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  25.11 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.54 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.54 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.16 
 
 
618 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  23.29 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  27.16 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.12 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  24.03 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.89 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.43 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.84 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  23.55 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  27.24 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  23.55 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  27.08 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.56 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  27.05 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  24.48 
 
 
553 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  23.67 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  23.95 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.91 
 
 
594 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  29.91 
 
 
594 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  25.26 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  30.96 
 
 
594 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.88 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.82 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.22 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  23.32 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  23.73 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  25 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  23.77 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  23.77 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  23.08 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  22.89 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  25.5 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  26.09 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  23.12 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.26 
 
 
577 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  26.23 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  26.11 
 
 
639 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  22.69 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  24.87 
 
 
644 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.91 
 
 
601 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  23.77 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  25.61 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  26.75 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.08 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  25.45 
 
 
635 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  24.85 
 
 
637 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  23.08 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.05 
 
 
573 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  29.79 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.31 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  25.47 
 
 
302 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  24.85 
 
 
637 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  25.82 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  24 
 
 
596 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  23.36 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  22.87 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  24.66 
 
 
290 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  19.76 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  25.61 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  29.25 
 
 
288 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  24.49 
 
 
623 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  25.62 
 
 
584 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  22.9 
 
 
287 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.01 
 
 
271 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  22.58 
 
 
285 aa  62  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.11 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.67 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.33 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  24.2 
 
 
615 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  25.57 
 
 
307 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  25.23 
 
 
629 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  25.11 
 
 
615 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  23.35 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  24.06 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  22.83 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  21.57 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.53 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  22.59 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  20.9 
 
 
304 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  23.33 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  24.8 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.17 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.86 
 
 
277 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  24.71 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  24.68 
 
 
648 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>