250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1310 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.7 
 
 
178 aa  244  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
177 aa  215  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
204 aa  214  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
184 aa  213  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.14 
 
 
186 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
184 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 
190 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.87 
 
 
194 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
187 aa  207  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 
178 aa  207  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 
180 aa  207  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
176 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.07 
 
 
184 aa  207  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
172 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.62 
 
 
183 aa  205  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  53.45 
 
 
180 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
176 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 
180 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.75 
 
 
182 aa  204  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.84 
 
 
183 aa  202  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.6 
 
 
182 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
176 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
176 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.98 
 
 
176 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.06 
 
 
180 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.14 
 
 
179 aa  201  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.56 
 
 
175 aa  201  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
174 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.39 
 
 
178 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
180 aa  201  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 
186 aa  201  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
180 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 
180 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 
181 aa  201  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 
193 aa  201  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.86 
 
 
181 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 
184 aa  200  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 
181 aa  200  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.8 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
182 aa  198  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
174 aa  198  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.9 
 
 
176 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.87 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.85 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.56 
 
 
188 aa  197  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
176 aa  197  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.98 
 
 
176 aa  197  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  54.86 
 
 
179 aa  197  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.81 
 
 
181 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
176 aa  197  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
187 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  53.71 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.76 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 
193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.3 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.22 
 
 
176 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.97 
 
 
175 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.71 
 
 
185 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.8 
 
 
174 aa  195  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  56.98 
 
 
183 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
184 aa  195  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.49 
 
 
182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1658  20S proteasome A and B subunits  56.4 
 
 
182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.67 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  55.75 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.05 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3389  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 
185 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.57 
 
 
182 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.41 
 
 
189 aa  194  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
174 aa  193  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.87 
 
 
185 aa  193  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
174 aa  193  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.63 
 
 
174 aa  193  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
176 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
176 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.49 
 
 
181 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  50 
 
 
182 aa  192  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.45 
 
 
174 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.05 
 
 
172 aa  193  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 
176 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.49 
 
 
181 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4559  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.19 
 
 
179 aa  193  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1175  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.91 
 
 
182 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.107278  normal  0.322219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>