More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1275 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  47.86 
 
 		 294 aa  239  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 277 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  42.37 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.73 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.4 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  43.84 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  42.39 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  44.48 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  39.78 
 
 		 289 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.4 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  43.07 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 286 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.85 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  42.27 
 
 		 307 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  39.05 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  41.45 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  41.67 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  41.11 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  42.45 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  44.01 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.24 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  44.29 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  43.6 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  40.07 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  44.33 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  41.49 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  39.42 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.39 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  41.76 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  39.78 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  40.15 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  41.97 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  40.65 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  40.79 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  40.71 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  41.01 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  40.99 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  39.63 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  39.63 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  39.63 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  39.57 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  39.63 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  39.63 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.99 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  38.46 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  39.57 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  42.44 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  40.55 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  38.83 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  40.48 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  39.27 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  38.79 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>