119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1201 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  100 
 
 		 406 aa  810    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  24.17 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  29.67 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  24.81 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  22 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  28.57 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  27.35 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  21.32 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  22.36 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  22.5 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  22.41 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  24.87 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  22.66 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  26.49 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  27.27 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  22.09 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  24.28 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  20.74 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  23.54 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  24.51 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  27.23 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  21.98 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  25.53 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  22.63 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  25.93 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  23.98 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  22.82 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  22.3 
 
 		 411 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  31.64 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  24.78 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  24.16 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  31.07 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  21.4 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  24.19 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  26.39 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  24 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  23.67 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  24 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  27.23 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  20.99 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  25.13 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  21.63 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  21.83 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  23.68 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  22.69 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  24.89 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  24.75 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.36 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  25.88 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  23.81 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  24.78 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.38 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  26.88 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  27.08 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  26.04 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  23.35 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  26.9 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  21.5 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  22.07 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  23.75 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  27.17 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  24.02 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  25.1 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  22.36 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  26.16 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  24.56 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  20.83 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  24.19 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  22.33 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  25.16 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  20.55 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  24.53 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  25.79 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  24.3 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  18.76 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  20.82 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  21.29 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  21.84 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  21.43 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  22.92 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  24.29 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  19.5 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  26.97 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  21.92 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.5 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  23.58 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  23.58 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>