More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1116 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 500 aa  1000    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  46.32 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 530 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.16 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.82 
 
 		 530 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 		 532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.71 
 
 		 594 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.71 
 
 		 594 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 		 533 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.43 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.85 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  37.14 
 
 		 533 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 		 532 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.19 
 
 		 848 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.4 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.73 
 
 		 849 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.63 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.46 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 		 525 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.93 
 
 		 535 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  35.55 
 
 		 556 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  36.86 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 534 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 534 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  36.23 
 
 		 533 aa  294  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.61 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.8 
 
 		 532 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.58 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 533 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  34.75 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  36.79 
 
 		 522 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 521 aa  289  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.81 
 
 		 856 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  36.23 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  34.85 
 
 		 534 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.67 
 
 		 535 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  35.26 
 
 		 526 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.91 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  36.23 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.99 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  33.6 
 
 		 534 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  35.2 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  35.45 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.05 
 
 		 856 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  33.53 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  33.53 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  32.99 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  36.45 
 
 		 526 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  35.73 
 
 		 508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 		 526 aa  273  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 632 aa  273  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  32.45 
 
 		 616 aa  273  7e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  33.4 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  33.53 
 
 		 604 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 		 615 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 		 615 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  33 
 
 		 615 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 604 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 843 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  32.8 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.1 
 
 		 839 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  32.8 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  32.16 
 
 		 616 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  31.38 
 
 		 615 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  32.85 
 
 		 533 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  37.19 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 595 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  31.38 
 
 		 614 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  33.47 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  33.27 
 
 		 625 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  33.4 
 
 		 633 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  31.85 
 
 		 612 aa  260  4e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  32.59 
 
 		 615 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  32.59 
 
 		 615 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  32.59 
 
 		 604 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3095  preprotein translocase subunit SecD  31.92 
 
 		 604 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  33.47 
 
 		 632 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  34.02 
 
 		 599 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>