139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1108 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.866947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  26.77 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  32.03 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  31.67 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  27.71 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  31.93 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  28.46 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  23.84 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  27.42 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  30.57 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.58 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  26.83 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.23 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  26.02 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  26.02 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  26.02 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  26.43 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.53 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.42 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  26.83 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  26.52 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  31.09 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  25.2 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  30.58 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  30.83 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  23.23 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.17 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  28.92 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  27.05 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  27.42 
 
 		 488 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.23 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  30.83 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  30.4 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  24.43 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  27.42 
 
 		 488 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  30.83 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  28 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  28.32 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  31.67 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  21.68 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  27.43 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  26.61 
 
 		 505 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  27.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  27.05 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  27.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  27.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.59 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  27.52 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  28.57 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  23.77 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  25.95 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>