More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1076 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
158 aa  319  9.000000000000001e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  45.95 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  45.95 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  49.32 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  42.86 
 
 
150 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  42.86 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  42.47 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  42.47 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  42.47 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  45.95 
 
 
148 aa  124  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  41.78 
 
 
148 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  42.64 
 
 
145 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  42.64 
 
 
145 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  40.15 
 
 
145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  39.42 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  38.85 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 
138 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  43.1 
 
 
137 aa  94  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  39.25 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  32.8 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  39.62 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  39.17 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  35.24 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  40.95 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  40.19 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  33.07 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  35.85 
 
 
126 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
127 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  37.14 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  40 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  33.83 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  40.19 
 
 
127 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  32.77 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  37.07 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  39.05 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  35.66 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  35.85 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  35.85 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  31.75 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  33.61 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  35.24 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  35.58 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  39.05 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  34.91 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  33.59 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  33.91 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  40 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  34.45 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  35.58 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  37.38 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  31.93 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  37.38 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  36.54 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  34.68 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  33.07 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  35.04 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  35.34 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  33.62 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  34.58 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  39.05 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  34.11 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  35.24 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>