29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1074 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  44.53 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  40.6 
 
 
132 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  40.6 
 
 
132 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  42.96 
 
 
133 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0511  hypothetical protein  39.17 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  37.9 
 
 
125 aa  84.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  34.35 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  35.82 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  33.91 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  33.09 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  28.8 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  28.8 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  30.95 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  29.32 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  31.25 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2508  hypothetical protein  33.05 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2139  hypothetical protein  33.05 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0135911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  29.41 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  27.13 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3114  hypothetical protein  37.25 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2712  hypothetical protein  37.25 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.548763  unclonable  0.0000000000219887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  32.67 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  36.73 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1083  hypothetical protein  26.23 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.712894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  32.67 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>