More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1073 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  51.37 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  52.24 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  54.62 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  54.62 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  46.94 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  46 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  45.27 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  45.27 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  43.54 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  39.58 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  38.89 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  37.76 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  36.99 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  34.93 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  39.47 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  39.47 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  38.84 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  38.84 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  40.71 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  32.87 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  38.17 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  39.67 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  37.1 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  38.21 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  38.52 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  31.72 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  32.31 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  39.06 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  36.89 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  36.92 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  37.98 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  36.59 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  41.28 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  36.13 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  34.96 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  32.5 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  33.85 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  33.85 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  35.16 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  34.75 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  33.59 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  42.2 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  38.89 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  34.38 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  34.09 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  33.06 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  32.46 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  32.5 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  37.19 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  37.19 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  32.81 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  37.93 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  35.61 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  34.85 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  35.48 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  35.43 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  35.54 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  33.6 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  33.9 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  32.52 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  41.41 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  34.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  33.88 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0030  glycine cleavage system H protein  35.25 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1809  glycine cleavage H-protein  35.54 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0431801  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  32.8 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  31.06 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  34.78 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>