More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1056 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 817 aa  666    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0632  leucyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 809 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 837 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 824 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 868 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0473  leucyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 813 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 826 aa  663    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 875 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 827 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 859 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 829 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 875 aa  655    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 858 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 810 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 859 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 861 aa  640    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 824 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 824 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 823 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 868 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 823 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 823 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 868 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 876 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 824 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 820 aa  643    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 878 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 817 aa  717    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 607 aa  852    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 872 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1056  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 599 aa  1246    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 819 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 829 aa  690    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 857 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000807673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 851 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 829 aa  656    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 857 aa  646    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 824 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 824 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 829 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 877 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 862 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0074  leucyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 821 aa  644    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 867 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 865 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 866 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 834 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 829 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 830 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 818 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 824 aa  672    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 906 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 826 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 819 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 828 aa  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 817 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 865 aa  654    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 854 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 872 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 820 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 853 aa  676    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 934 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 856 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 824 aa  700    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 856 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 868 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 817 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 825 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 863 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 870 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 871 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 863 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 815 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 828 aa  670    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 929 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 859 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 859 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 864 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 872 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 824 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 827 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 819 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 825 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 868 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 859 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 829 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 859 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 859 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 865 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 856 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 823 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 831 aa  675    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 864 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 921 aa  633  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 830 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 821 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 859 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 860 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 864 aa  631  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>