More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1012 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 883 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 980 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 658 aa  653    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 1161 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.42 
 
 		 732 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 		 920 aa  641    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 1029 aa  652    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.15 
 
 		 884 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  58.23 
 
 		 903 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 854 aa  1680    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  57.09 
 
 		 888 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.85 
 
 		 882 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  56.27 
 
 		 739 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  55.81 
 
 		 986 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  62.77 
 
 		 928 aa  711    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  56.29 
 
 		 860 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 		 686 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  46.4 
 
 		 971 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 924 aa  653    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 		 882 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  54.29 
 
 		 822 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.12 
 
 		 949 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 985 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  58.64 
 
 		 845 aa  685    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  59.69 
 
 		 692 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.87 
 
 		 997 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.05 
 
 		 947 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 689 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  55.04 
 
 		 879 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  52.01 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  57.82 
 
 		 1035 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 705 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 686 aa  629  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.76 
 
 		 705 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.29 
 
 		 921 aa  628  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 1079 aa  628  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.94 
 
 		 688 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 1079 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 688 aa  622  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 679 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 679 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 1131 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 949 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.38 
 
 		 907 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 		 656 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 936 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.88 
 
 		 895 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 915 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  52.48 
 
 		 984 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  51.56 
 
 		 876 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  47.93 
 
 		 884 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.02 
 
 		 881 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 968 aa  612  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  51.41 
 
 		 879 aa  612  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  51.94 
 
 		 991 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.18 
 
 		 752 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  47.48 
 
 		 885 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  51.32 
 
 		 602 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 922 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 952 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.4 
 
 		 880 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 979 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  48.33 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 882 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  49.36 
 
 		 1058 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  51.91 
 
 		 904 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  50.83 
 
 		 668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  51.26 
 
 		 843 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  51.59 
 
 		 948 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 962 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.33 
 
 		 889 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 964 aa  602  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 929 aa  600  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 738 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  52.11 
 
 		 1022 aa  599  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 912 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  52.85 
 
 		 673 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 940 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 		 984 aa  601  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 964 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 945 aa  597  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.36 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 		 941 aa  598  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 711 aa  598  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  50.58 
 
 		 992 aa  598  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 943 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>