More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0976 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
243 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
246 aa  164  1e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
243 aa  162  5e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
246 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
246 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
248 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
246 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
254 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
243 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
246 aa  136  3e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
245 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
270 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
248 aa  131  1e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
247 aa  130  2e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  34.3 
 
 
240 aa  129  4e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  28.05 
 
 
245 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 
247 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
245 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
244 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
243 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  27.94 
 
 
249 aa  120  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30 
 
 
251 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
249 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
255 aa  114  1e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
250 aa  114  2e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
254 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 
245 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
260 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
257 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.14 
 
 
247 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
257 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 
255 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
242 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  25.68 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  25.73 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  23.98 
 
 
256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  23.98 
 
 
256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  23.98 
 
 
256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  29.1 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.56 
 
 
256 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  24.51 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  26.72 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  27.5 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  25.41 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  26.56 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
309 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  25.93 
 
 
270 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  26.02 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 
252 aa  84.7  1e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 
251 aa  84  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.92 
 
 
273 aa  84  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  25.83 
 
 
259 aa  84  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.21 
 
 
257 aa  84.3  2e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
238 aa  83.6  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  26.14 
 
 
240 aa  84.3  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
231 aa  83.6  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 
247 aa  83.2  3e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
231 aa  83.6  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 
267 aa  83.6  3e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.58 
 
 
258 aa  82.8  4e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 
249 aa  83.2  4e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
238 aa  82.4  6e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
272 aa  82  8e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
243 aa  81.6  9e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.17 
 
 
247 aa  81.6  9e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.51 
 
 
248 aa  81.6  1e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>