More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0968 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 
211 aa  210  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 
213 aa  141  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 
213 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.62 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.41 
 
 
442 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.89 
 
 
442 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
214 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
459 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
202 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
201 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
201 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
214 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.98 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.86 
 
 
442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.48 
 
 
213 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.97 
 
 
442 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.48 
 
 
200 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.48 
 
 
200 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
448 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
449 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
448 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
445 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
214 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.37 
 
 
547 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.92 
 
 
442 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.46 
 
 
442 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
447 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 
443 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
200 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.71 
 
 
444 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.46 
 
 
442 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
233 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
240 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 
212 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.7 
 
 
222 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
222 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
205 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.84 
 
 
203 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.62 
 
 
196 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.34 
 
 
203 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.75 
 
 
203 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
402 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
447 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32 
 
 
203 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
207 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.75 
 
 
203 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
207 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.8 
 
 
203 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
206 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.89 
 
 
203 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.8 
 
 
203 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
209 aa  99  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
370 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
253 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.07 
 
 
427 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
452 aa  95.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
411 aa  95.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
204 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
188 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
412 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
209 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
212 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
243 aa  91.3  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.22 
 
 
243 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  32.53 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>