More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0954 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 
189 aa  190  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
195 aa  164  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
213 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.78 
 
 
183 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 
185 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
193 aa  157  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 
191 aa  155  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
187 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
194 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 
184 aa  151  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
207 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
202 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
207 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 
210 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  40.51 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
186 aa  145  3e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  43.71 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
206 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
187 aa  141  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
186 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
192 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  39.55 
 
 
207 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.7 
 
 
189 aa  140  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  41.28 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  42.01 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.34 
 
 
199 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  38.8 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  36.98 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.37 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 
181 aa  137  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  40.22 
 
 
187 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.24 
 
 
189 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  44.67 
 
 
232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  41.07 
 
 
228 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  41.76 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
193 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  43.92 
 
 
213 aa  134  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  37.91 
 
 
188 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
196 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  38.69 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  35.45 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  37.65 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  38.29 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  39.66 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.33 
 
 
193 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
211 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 
211 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  37.36 
 
 
188 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  40.61 
 
 
239 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  46 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  41.14 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  39.63 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  38.98 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  39.07 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.78 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.32 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  44.1 
 
 
365 aa  129  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
217 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04025  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 
219 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  44.3 
 
 
225 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  37.79 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  37.08 
 
 
190 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  37.08 
 
 
190 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 
190 aa  127  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  35.52 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  44.37 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>