More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0936 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  100 
 
 
433 aa  851    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  54 
 
 
429 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  52.06 
 
 
431 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  51.94 
 
 
457 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  53.66 
 
 
438 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  52.06 
 
 
428 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.67 
 
 
434 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  50.93 
 
 
451 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  50.86 
 
 
449 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.76 
 
 
444 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50 
 
 
467 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  50.48 
 
 
438 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  49.16 
 
 
504 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  49.07 
 
 
435 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  50.48 
 
 
438 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.91 
 
 
405 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  48.92 
 
 
444 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.04 
 
 
433 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  48.92 
 
 
478 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  48.44 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  48.92 
 
 
500 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  48.92 
 
 
500 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  47.78 
 
 
434 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  48.92 
 
 
466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  48.2 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  48.2 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  48.92 
 
 
466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  48.2 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  48.92 
 
 
466 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.28 
 
 
410 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  48.28 
 
 
411 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.28 
 
 
410 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.52 
 
 
410 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.52 
 
 
410 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.52 
 
 
410 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  48.2 
 
 
469 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  48.88 
 
 
402 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.28 
 
 
410 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.03 
 
 
410 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  46.65 
 
 
402 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.78 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  47.12 
 
 
501 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.35 
 
 
436 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  48.13 
 
 
489 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  46.63 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  46.42 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  49.16 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  49.16 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.44 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.52 
 
 
461 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  46.15 
 
 
405 aa  354  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  50.12 
 
 
433 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  44.22 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  48.1 
 
 
461 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  46.98 
 
 
488 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  46.41 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  48.5 
 
 
464 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  47.24 
 
 
499 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  45.85 
 
 
406 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  47.72 
 
 
502 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  45.95 
 
 
413 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.98 
 
 
515 aa  348  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  47.03 
 
 
400 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  45.27 
 
 
499 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.06 
 
 
462 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  46.05 
 
 
485 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.93 
 
 
436 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  45.64 
 
 
436 aa  346  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.96 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  46.51 
 
 
515 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.77 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.65 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  46.67 
 
 
445 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  45.64 
 
 
397 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  46.97 
 
 
431 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  45.52 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  47.29 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  44.01 
 
 
513 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  43.78 
 
 
510 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  45.85 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  44.7 
 
 
515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  47.13 
 
 
468 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  44.39 
 
 
524 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  46.17 
 
 
459 aa  336  5.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  44.42 
 
 
445 aa  335  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  45.27 
 
 
399 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  40.39 
 
 
500 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  46.76 
 
 
466 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  43.52 
 
 
432 aa  333  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  46.55 
 
 
408 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  47.28 
 
 
402 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  40 
 
 
506 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.57 
 
 
499 aa  332  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.55 
 
 
408 aa  332  9e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  46.95 
 
 
444 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.99 
 
 
405 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  47.92 
 
 
433 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  45.99 
 
 
432 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  45.97 
 
 
427 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.21 
 
 
432 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>