159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0931 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 343 aa  694    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  41.74 
 
 		 530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.28 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  38.51 
 
 		 356 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.51 
 
 		 356 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  34.78 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.93 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.22 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  38.8 
 
 		 245 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.75 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  29.91 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.76 
 
 		 261 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.91 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  31.76 
 
 		 257 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  27.16 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.33 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.31 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  26.23 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.74 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.74 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  27.6 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.78 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1549  CO dehydrogenase beta subunit/acetyl-CoA synthase epsilon subunit  28.71 
 
 		 667 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  34.52 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.06 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.25 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.14 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.78 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  29.25 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.03 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  30.13 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.24 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.6 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  31.75 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.04 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  27.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.96 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.76 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  27.24 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  27.14 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  27.31 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.51 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.67 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.77 
 
 		 329 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  30.5 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.33 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  33.86 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  26.64 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  31.69 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  25.68 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.67 
 
 		 275 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.74 
 
 		 259 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.05 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.84 
 
 		 240 aa  89.4  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  24.63 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  27.02 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.49 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  29.86 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  28.16 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  28.31 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  23.65 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  28.7 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.27 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  27.94 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  24.32 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.34 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  28.44 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  28.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  28.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  23.73 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  28.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  28.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  28.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  27.75 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.81 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  23.94 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.2 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.75 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  27.75 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  23.94 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.55 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  27.27 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  27.27 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.16 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  26.79 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  26.32 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>