41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0920 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  100 
 
 
619 aa  1244    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  24.07 
 
 
746 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  23.47 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  26.51 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  22.68 
 
 
755 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 
455 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  25.64 
 
 
676 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  22.95 
 
 
672 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  24.73 
 
 
657 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  23.3 
 
 
682 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
615 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  22.6 
 
 
615 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 
657 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  23.87 
 
 
629 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  30.28 
 
 
656 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
664 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
664 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
664 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
664 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  25.6 
 
 
680 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  23.26 
 
 
615 aa  50.8  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  23.19 
 
 
609 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  23.19 
 
 
609 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  22.4 
 
 
609 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  21.17 
 
 
655 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  29.08 
 
 
685 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  28.57 
 
 
680 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  28.68 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  25.53 
 
 
683 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  37.97 
 
 
614 aa  48.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  23.2 
 
 
585 aa  47.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  24.54 
 
 
612 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  23.62 
 
 
668 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  22.98 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  22.98 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  22.25 
 
 
674 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  22.31 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  21.5 
 
 
672 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 
653 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  23.62 
 
 
731 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
612 aa  44.3  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>