More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0912 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  43.1 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.39 
 
 		 322 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.67 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  40.6 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.06 
 
 		 322 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.81 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.44 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35.69 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.25 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.81 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  38.21 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.93 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  35.82 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.18 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.66 
 
 		 324 aa  168  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  35.2 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  33.77 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.95 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.22 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  36.63 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  35.71 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  35.69 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  39.21 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  40.76 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  35.08 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.79 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  32.36 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.68 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.51 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.67 
 
 		 345 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  38.3 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.34 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.11 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  32.79 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.33 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  32.77 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  38.33 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  43.44 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  38.77 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  34.14 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.33 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.8 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  34.49 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  32.77 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  35.34 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.45 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.05 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  38.33 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  34.26 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  35.34 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  35.34 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  38.33 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  38.16 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.11 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 340 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.45 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.57 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  37.89 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  33.71 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.68 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.1 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  35.29 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  33.44 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>