More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0894 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  50.36 
 
 		 709 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  63.17 
 
 		 704 aa  851    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 700 aa  1436    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  49.63 
 
 		 672 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  47.21 
 
 		 673 aa  598  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  48.34 
 
 		 662 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  45.28 
 
 		 677 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 688 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 688 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.87 
 
 		 668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  45.27 
 
 		 677 aa  566  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.82 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45.03 
 
 		 666 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  45.54 
 
 		 672 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  44 
 
 		 680 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 668 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  44.97 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.53 
 
 		 663 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.59 
 
 		 674 aa  559  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 663 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.53 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  45.25 
 
 		 681 aa  558  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.68 
 
 		 673 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 684 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  43.98 
 
 		 675 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.18 
 
 		 676 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  44.43 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  43.06 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.53 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  44.17 
 
 		 685 aa  551  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.6 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  44.08 
 
 		 675 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.86 
 
 		 683 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  43.11 
 
 		 707 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 		 691 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.4 
 
 		 718 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  43.26 
 
 		 712 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  43.87 
 
 		 659 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  43.95 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  44.35 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 673 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  42.22 
 
 		 678 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  42.18 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.62 
 
 		 726 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.32 
 
 		 671 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  42.18 
 
 		 668 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  45.08 
 
 		 662 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  44.05 
 
 		 746 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.05 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  44.99 
 
 		 678 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.82 
 
 		 670 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 697 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  43.9 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 711 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.75 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  43.44 
 
 		 683 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.9 
 
 		 669 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  43.62 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  42.26 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.56 
 
 		 679 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 674 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  41.24 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.9 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 688 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  43.8 
 
 		 688 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 673 aa  534  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 690 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.75 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  42.44 
 
 		 675 aa  535  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  43.56 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.64 
 
 		 670 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  43.15 
 
 		 672 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.5 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.5 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  39.82 
 
 		 684 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.69 
 
 		 694 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  42.16 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>