More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0877 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
217 aa  424  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  50.93 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  46.01 
 
 
225 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  44.5 
 
 
226 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  44.02 
 
 
226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  44.02 
 
 
226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  42.72 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  44.55 
 
 
225 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  44.08 
 
 
226 aa  148  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  43 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  44.44 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  38.64 
 
 
233 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  43.68 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  44.74 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  41.75 
 
 
229 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  41.38 
 
 
234 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  41.75 
 
 
229 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  37.73 
 
 
233 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  43.16 
 
 
229 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  40.38 
 
 
226 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  40.53 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  42.63 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  40.28 
 
 
224 aa  135  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  37.61 
 
 
234 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  41.67 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 
233 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  37.56 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  42.02 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  37.04 
 
 
234 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  40.48 
 
 
239 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  32.34 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  36.5 
 
 
258 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  35.55 
 
 
218 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
260 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  31.25 
 
 
243 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  32.2 
 
 
243 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  31.46 
 
 
246 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.2 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  34.72 
 
 
303 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
228 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  34.36 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
261 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
261 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
249 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  29.22 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  32.83 
 
 
342 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  34.15 
 
 
249 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  30.43 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.11 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  31.65 
 
 
247 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  34.41 
 
 
312 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 
284 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  32.23 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  30.88 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  30.19 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  31.39 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.88 
 
 
251 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  39.35 
 
 
249 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 
258 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  32.42 
 
 
271 aa  88.2  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  32.82 
 
 
248 aa  88.2  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
341 aa  88.2  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  34.25 
 
 
364 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 
250 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  32.68 
 
 
247 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  28.77 
 
 
345 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  31.49 
 
 
261 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  27.91 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0147  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
273 aa  87  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0584066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  32.19 
 
 
283 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.96 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  30.85 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  33.8 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  35.56 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  30.41 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  29.41 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0430  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
265 aa  85.1  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000235432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.49 
 
 
235 aa  85.1  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  33.81 
 
 
275 aa  84.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  30.4 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  31.63 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.95 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  31.22 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  31.37 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000111234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  32.43 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  32.29 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>