298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0807 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 348 aa  708    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  34.19 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  34.19 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.22 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.36 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  30.26 
 
 		 397 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 453 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.54 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.71 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.71 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.52 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.44 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.42 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.14 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.02 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  22.78 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.04 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.14 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.53 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.27 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  25.72 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  24.92 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.79 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.16 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  27.24 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  24.41 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.19 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 392 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  22.61 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>