47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0794 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1395  Carbohydrate-selective porin OprB  96.38 
 
 		 471 aa  898    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.567539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0794  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 473 aa  966    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000421873  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6797  Carbohydrate-selective porin OprB  29.84 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0411  hypothetical protein  30.87 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1195  hypothetical protein  29.65 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.282348  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  29.36 
 
 		 674 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.93 
 
 		 661 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1331  carbohydrate-selective porin OprB  31.7 
 
 		 494 aa  186  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  29.36 
 
 		 692 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.38 
 
 		 710 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  29.31 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4992  Carbohydrate-selective porin OprB  28.6 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3545  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.29 
 
 		 437 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.339839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2536  Carbohydrate-selective porin OprB  28.6 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.761533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1039  Carbohydrate-selective porin OprB  29.89 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.661938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1131  Carbohydrate-selective porin OprB  29.89 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0352  carbohydrate-selective porin OprB  29.89 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 		 708 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  28.51 
 
 		 662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1665  Carbohydrate-selective porin OprB  29.4 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2951  Carbohydrate-selective porin OprB  29.4 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.11 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1590  Carbohydrate-selective porin OprB  28.89 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3166  Carbohydrate-selective porin OprB  28.89 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  hitchhiker  0.000000000149961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  27.13 
 
 		 693 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  27.31 
 
 		 703 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  29.33 
 
 		 670 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  27.09 
 
 		 703 aa  163  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  28.41 
 
 		 680 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0703  carbohydrate-selective porin OprB  28.63 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  27.02 
 
 		 703 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  28.57 
 
 		 724 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4280  carbohydrate-selective porin OprB  27.16 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  27.29 
 
 		 665 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0647  Carbohydrate-selective porin OprB  26.53 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2120  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.34 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06177  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1112  hypothetical protein  23 
 
 		 490 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.503741  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  22.86 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  23.69 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  27.65 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  22.29 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  24.3 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  23.53 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2751  carbohydrate-selective porin OprB  26.32 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.202947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  23.6 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  22.8 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>