More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0678 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.31 
 
 		 598 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 608 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  56.95 
 
 		 598 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 615 aa  655    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  53.14 
 
 		 607 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  53.06 
 
 		 609 aa  640    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  52.04 
 
 		 600 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 614 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.38 
 
 		 602 aa  648    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 608 aa  656    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 608 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 		 630 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 		 607 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 614 aa  663    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  53.28 
 
 		 614 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  56.66 
 
 		 600 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  53.28 
 
 		 614 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  75.42 
 
 		 608 aa  935    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  53.31 
 
 		 608 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  53.31 
 
 		 608 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  60 
 
 		 614 aa  740    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 		 607 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  55.43 
 
 		 650 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 598 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 		 641 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  54.22 
 
 		 600 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  53.89 
 
 		 610 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.97 
 
 		 596 aa  682    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.14 
 
 		 596 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  53.11 
 
 		 614 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 		 609 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 		 612 aa  678    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.73 
 
 		 602 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  58.08 
 
 		 616 aa  712    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 		 610 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  55.21 
 
 		 600 aa  668    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 608 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  55.9 
 
 		 602 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 598 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  56.71 
 
 		 614 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.92 
 
 		 610 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 614 aa  663    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  55.03 
 
 		 613 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  56.95 
 
 		 598 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  57.44 
 
 		 597 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 603 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0210  GTP-binding protein TypA/BipA  54.04 
 
 		 609 aa  637    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.486829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 		 592 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 		 607 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  57.41 
 
 		 615 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  54.19 
 
 		 620 aa  671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 		 608 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  53.31 
 
 		 602 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  53.91 
 
 		 608 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  53.31 
 
 		 602 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  56.8 
 
 		 599 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  56.2 
 
 		 627 aa  673    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.38 
 
 		 602 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  53.78 
 
 		 614 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 		 622 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 599 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  52.8 
 
 		 607 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  62.12 
 
 		 605 aa  745    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 593 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  61.02 
 
 		 606 aa  742    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  55.88 
 
 		 598 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  51.95 
 
 		 607 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 610 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 		 610 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  56.95 
 
 		 598 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 596 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  52.8 
 
 		 607 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 		 602 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 594 aa  1198    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  53.14 
 
 		 607 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.68 
 
 		 608 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.21 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  53.22 
 
 		 608 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  55.56 
 
 		 600 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 		 615 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 642 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  55.69 
 
 		 613 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  58.75 
 
 		 594 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  53.14 
 
 		 607 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  52.89 
 
 		 602 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.13 
 
 		 601 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1793  GTP-binding protein TypA  53.79 
 
 		 608 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  54.04 
 
 		 631 aa  664    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  54.81 
 
 		 608 aa  672    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  52.04 
 
 		 600 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  57.8 
 
 		 613 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  53.46 
 
 		 608 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.8 
 
 		 607 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  54.07 
 
 		 615 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>