More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0670 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
464 aa  945  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
478 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
485 aa  418  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
490 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
486 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
485 aa  405  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
477 aa  407  1e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
490 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
481 aa  400  1e-110  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
482 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
467 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
466 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
480 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
491 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
485 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
469 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
479 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
466 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
466 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.91 
 
 
495 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
465 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
474 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
463 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
468 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
464 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
474 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
488 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
474 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
471 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
468 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
469 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
494 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
469 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
488 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
467 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
463 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
467 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
472 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
484 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
484 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.37 
 
 
518 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
470 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
480 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.72182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.65684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.33167e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
471 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
470 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  358  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  358  1e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.12104e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
469 aa  358  1e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.69422e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
469 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.28448e-07  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
469 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.282e-08  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
469 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.9188e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  357  2e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.45575e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  357  2e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.1517e-06  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
491 aa  358  2e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  357  3e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.07097e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  357  3e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.63468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
488 aa  357  3e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  357  3e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.85345e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  357  3e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.73 
 
 
471 aa  357  3e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.11719e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
464 aa  357  3e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  357  4e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.08657e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
471 aa  356  4e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.52174e-07  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
469 aa  356  4e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  356  4e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.24879e-07  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
469 aa  356  4e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.88711e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
471 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.72763e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
490 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
484 aa  355  7e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
481 aa  355  8e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
469 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.65413e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
471 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
473 aa  353  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.8789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
471 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
468 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
501 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
471 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.38412e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
509 aa  352  6e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
464 aa  352  9e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
469 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
471 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.64093e-09  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
470 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
475 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
465 aa  350  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
471 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.00457e-07  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
469 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
469 aa  349  5e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
469 aa  349  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.59151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
491 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
469 aa  348  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  8.36575e-07  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
492 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.03 
 
 
546 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
471 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
472 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
470 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>