30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0592 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 371 aa  779    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  51.38 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  51.24 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  49.14 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  49.14 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  45.13 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 266 aa  85.9  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26.13 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.03 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  20.5 
 
 		 282 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  20.2 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>