More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0522 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 420 aa  846    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  57.58 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  51.69 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  50.25 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  52.35 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  51.72 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  49.64 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  48.88 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  49.75 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  50.62 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  45.89 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  48.01 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  47.7 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  48.91 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  49.12 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  49.12 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  47.16 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  47.16 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  48.24 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  47.65 
 
 		 416 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  49.39 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  46.51 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  49.88 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  47.91 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  47.51 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  44.05 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  45.67 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  48.38 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  47.24 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  46.54 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  45.65 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  47.01 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  46.97 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  45.5 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  47.02 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  44.1 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  48.89 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  47.45 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  48.76 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  49.25 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  45.2 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  47.37 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  46.27 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  46.78 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  45.77 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  47.02 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  45.06 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  47.9 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  46.65 
 
 		 415 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  47.65 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  46.59 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  47.42 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  46.68 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  45.5 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  46.62 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  46.87 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  47.42 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  46.17 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  46.62 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  48.64 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  44.74 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  46.32 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  45.02 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  46.27 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  46.49 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  45.74 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  45.48 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  46.67 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  44.52 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  45.5 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  47.02 
 
 		 420 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  49.13 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  44.94 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  46.96 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  44.36 
 
 		 420 aa  362  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  49.75 
 
 		 407 aa  362  9e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  45.27 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  45.27 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  45.27 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  42.22 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  46.77 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 414 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 414 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  45.45 
 
 		 422 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 415 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  47.06 
 
 		 421 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  45.34 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>