More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0494 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  65.29 
 
 		 464 aa  634    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  65.29 
 
 		 464 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  100 
 
 		 464 aa  953    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  65.49 
 
 		 471 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  64.57 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  64.63 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  63.1 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  62.2 
 
 		 459 aa  605  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  61.98 
 
 		 459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  62.26 
 
 		 463 aa  589  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 466 aa  588  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  62.26 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  62.04 
 
 		 463 aa  584  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  62.26 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  59.61 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  61 
 
 		 466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  59.44 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  61.12 
 
 		 465 aa  570  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 465 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  58.19 
 
 		 544 aa  564  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  60.69 
 
 		 465 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 462 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  58.52 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  59.61 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  60.04 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  59.61 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 478 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  59.4 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  59.18 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  58.96 
 
 		 462 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  58.96 
 
 		 462 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  58.66 
 
 		 492 aa  556  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  55.53 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  58.02 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  58.7 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  60 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  58.13 
 
 		 468 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 465 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 461 aa  548  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  58.02 
 
 		 631 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  59.13 
 
 		 465 aa  548  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  58.02 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  57.3 
 
 		 487 aa  548  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  60.65 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 462 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  57.8 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  56.92 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  57.92 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 472 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  55.68 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2054  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  57.14 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  57.36 
 
 		 510 aa  539  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  59.44 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  55.6 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>