More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0479 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  49.76 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.75 
 
 
210 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.31 
 
 
209 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 
209 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
251 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
209 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
209 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
216 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 
209 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 
221 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.89 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 
206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  40.1 
 
 
207 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 
209 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  39.32 
 
 
222 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  40.87 
 
 
214 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 
209 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
209 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  39.61 
 
 
213 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 
206 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
215 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 
205 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  36.97 
 
 
222 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.26 
 
 
214 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 
208 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
215 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.14 
 
 
211 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
215 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
211 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
215 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.76 
 
 
215 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  37.32 
 
 
230 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
205 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
214 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  36.49 
 
 
222 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 
215 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
214 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
206 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 
215 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 
218 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 
215 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  36.97 
 
 
224 aa  141  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
214 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  37.56 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  34.6 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
214 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
215 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
214 aa  138  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 
217 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 
209 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  35.44 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 
213 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  34.23 
 
 
225 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  35.94 
 
 
215 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 
210 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 
214 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 
210 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.93 
 
 
224 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.68 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.49 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
215 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
214 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0988  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 
214 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520901  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.49 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
214 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 
231 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>