More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0449 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0449  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000993889  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 79 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.78 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  54.29 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  60.61 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  45.83 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  46.38 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  55.88 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0782  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.04238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  50.82 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  48.57 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  45.83 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  64 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  49.25 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  45.07 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  43.66 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  57.89 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  43.66 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  56.6 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  45.07 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  48.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  56 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>