More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0353 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.97 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 424 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  32.91 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  45.9 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.11 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  31.68 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>