More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0296 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  100 
 
 		 435 aa  872    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  51.7 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  48.87 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  45.89 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  49.3 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.28 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  46.4 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  46.49 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.16 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  46.81 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  46.34 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  46.26 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  46.26 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  46.96 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  46.01 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  45.79 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  46.5 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  45.79 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  43.91 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  49.28 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  44.76 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  45.25 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.36 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  44.92 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.02 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.3 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  44.95 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  44.13 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  46.42 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.23 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  43.68 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  46.44 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  45.98 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  43.98 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  44.91 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  44.32 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.03 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  46.03 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  44.64 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.71 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.17 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  45.48 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  44.44 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  45.07 
 
 		 521 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  45.1 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  44.22 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  45.77 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  44.22 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  43.19 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.63 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  44.99 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  44.08 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  42.19 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  44.22 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.39 
 
 		 449 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  44.19 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  44.95 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  42.56 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.38 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  42.56 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  44.95 
 
 		 461 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  42.57 
 
 		 449 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  46.24 
 
 		 520 aa  363  3e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  42.55 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  43.88 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  43.18 
 
 		 522 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  43.54 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  43.54 
 
 		 453 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  43.86 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  42.33 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  42.33 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  42.39 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  42.33 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  43.54 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  44.19 
 
 		 458 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.56 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  42.43 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  42.4 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  42.38 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  42.38 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  43.49 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1006  signal recognition particle protein  45.66 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0974  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  42.56 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  44 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  44.39 
 
 		 449 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  43.93 
 
 		 449 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>