More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0290 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  73.04 
 
 		 116 aa  176  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.48 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3294  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2996  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  61.02 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3157  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2927  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3274  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000858241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2304  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0403  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0395  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  58.73 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 127 aa  146  7e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0350  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0623  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 123 aa  143  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 121 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>