More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0280 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  100 
 
 		 181 aa  357  5e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  49.41 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.1 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  48.54 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  47.06 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.33 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  44.38 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  47.73 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  45.2 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  45.45 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  48.33 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  44 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  46.11 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  45 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  44.63 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  48 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  45.14 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  44.63 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  46.63 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>