More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0246 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  100 
 
 
560 aa  1131    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  44.39 
 
 
577 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  49 
 
 
871 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.7 
 
 
599 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.7 
 
 
599 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.88 
 
 
599 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.53 
 
 
559 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.31 
 
 
787 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  43.79 
 
 
568 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.75 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.47 
 
 
603 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.34 
 
 
568 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  43.54 
 
 
568 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.54 
 
 
568 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.32 
 
 
571 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.94 
 
 
563 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.36 
 
 
568 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.25 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.35 
 
 
558 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.49 
 
 
568 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.04 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.06 
 
 
571 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.99 
 
 
569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.07 
 
 
568 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.67 
 
 
520 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.19 
 
 
563 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  42.14 
 
 
553 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.16 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.54 
 
 
553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  44.05 
 
 
562 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.04 
 
 
565 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
556 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.03 
 
 
571 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.7 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.11 
 
 
553 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.38 
 
 
514 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 
520 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  44.32 
 
 
563 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  36.83 
 
 
587 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.97 
 
 
520 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
555 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
567 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.13 
 
 
558 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 
520 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  44.79 
 
 
563 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43.55 
 
 
570 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.38 
 
 
885 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
569 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
568 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.68 
 
 
557 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.22 
 
 
568 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
573 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  42.99 
 
 
566 aa  389  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  43.37 
 
 
566 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.2 
 
 
577 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  41.1 
 
 
666 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.2 
 
 
577 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  42.27 
 
 
567 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  45.83 
 
 
668 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.27 
 
 
570 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  39.7 
 
 
578 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.67 
 
 
555 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.85 
 
 
500 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.2 
 
 
521 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  39.93 
 
 
561 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  48.21 
 
 
727 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
527 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.59 
 
 
501 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  39.85 
 
 
670 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  45.97 
 
 
670 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  48.09 
 
 
499 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  42.62 
 
 
503 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.74 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  48.85 
 
 
514 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  44.52 
 
 
523 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  39.56 
 
 
575 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.92 
 
 
580 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.45 
 
 
578 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.86 
 
 
497 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  45.27 
 
 
487 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.26 
 
 
553 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  41.51 
 
 
577 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  47.58 
 
 
520 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.29 
 
 
574 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  41.3 
 
 
585 aa  376  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.61 
 
 
571 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.56 
 
 
578 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  39.28 
 
 
595 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  46.62 
 
 
497 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.64 
 
 
561 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
746 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  45.27 
 
 
469 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
580 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  43.14 
 
 
561 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  46.62 
 
 
497 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  43.2 
 
 
477 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  47.06 
 
 
471 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  46.12 
 
 
497 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
578 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>