More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0077 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
322 aa  655    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  30.53 
 
 
447 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  34.96 
 
 
523 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
498 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.82 
 
 
547 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  35.93 
 
 
595 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 
405 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 
620 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  36.02 
 
 
495 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 
618 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  40.33 
 
 
544 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  34.32 
 
 
587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  40.54 
 
 
440 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  35.85 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  33.62 
 
 
638 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.63 
 
 
452 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
455 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
406 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 
570 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.85 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 
523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  36.71 
 
 
650 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.52 
 
 
733 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.71 
 
 
475 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  34.26 
 
 
522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  34.22 
 
 
448 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  34.55 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  34.87 
 
 
1079 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1361  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  32.41 
 
 
507 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.33 
 
 
451 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
661 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
556 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1814  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 
276 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  33.19 
 
 
561 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.54 
 
 
1001 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.66 
 
 
617 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 
1021 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 
693 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0034  Lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 
355 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.312775  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
459 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 
610 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 
487 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.77 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  44.53 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  31.49 
 
 
415 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 
596 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  32.31 
 
 
484 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  34.15 
 
 
562 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  34.38 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.8 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  32.75 
 
 
499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  31.72 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  30.38 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0300  regulatory protein dnir  33.78 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.89505  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.33 
 
 
372 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  34.74 
 
 
383 aa  116  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.49 
 
 
372 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.8 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  37.89 
 
 
557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.25 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.47 
 
 
612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.88 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.59 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  28.2 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  29.02 
 
 
516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  35.59 
 
 
487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  33.47 
 
 
612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 
578 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 
527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.88 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  28.9 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  28.52 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  31.44 
 
 
506 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  34.86 
 
 
451 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 
538 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  36.48 
 
 
516 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.25 
 
 
534 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 
467 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  29.08 
 
 
483 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  32.86 
 
 
476 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  33.33 
 
 
476 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  36.54 
 
 
501 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  32.86 
 
 
476 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  32.07 
 
 
511 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>