More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0075 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  70.65 
 
 
244 aa  294  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  34.52 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  35.35 
 
 
205 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  35.35 
 
 
205 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  33.99 
 
 
305 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 
197 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  32.04 
 
 
198 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  34.34 
 
 
192 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  38.81 
 
 
214 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  33.86 
 
 
208 aa  104  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  33.86 
 
 
203 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  30.65 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  34.95 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  31.18 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  32.98 
 
 
205 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  32.11 
 
 
206 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 
192 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  31.94 
 
 
199 aa  101  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  33.51 
 
 
197 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  33.5 
 
 
302 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  29.84 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  34.69 
 
 
209 aa  99  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  34.18 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.78 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  30.43 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  30.22 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  33.33 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  31.61 
 
 
308 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  29.89 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  30.43 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  31.25 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  33.33 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  31.31 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  36.7 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  34.18 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  30.11 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  33.7 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  30.54 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  32.45 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  32.16 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  32.97 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  33.7 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  35.11 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  32.09 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  32.09 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  32.09 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  34.48 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  32.83 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  31.25 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  32.83 
 
 
201 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  30.53 
 
 
224 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  31.47 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  31.47 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  29.79 
 
 
200 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  32.07 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  29.95 
 
 
202 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  30.96 
 
 
304 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  30.96 
 
 
304 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  32.79 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  27.68 
 
 
269 aa  93.2  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  30.11 
 
 
348 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  31.77 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  30.98 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  31.18 
 
 
437 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  31.77 
 
 
209 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  29.53 
 
 
194 aa  92  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  32.98 
 
 
200 aa  92  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  32.12 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  33.16 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  30.46 
 
 
304 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  32.98 
 
 
200 aa  91.7  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  35.64 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  35.64 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  29.02 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  28.71 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  30.37 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  30.27 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  34.05 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  31.52 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  30.81 
 
 
304 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  30.16 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  29.89 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  29.38 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  30.43 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  29.57 
 
 
226 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0843  superoxide dismutase, Fe  33.68 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2595  superoxide dismutase  34.36 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.765686  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  34.8 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  32.8 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  32.63 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  30.77 
 
 
226 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  33.71 
 
 
207 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  29.74 
 
 
200 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>