More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0069 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
262 aa  533  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  49.25 
 
 
268 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 
269 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
270 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
267 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  45.39 
 
 
269 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  44 
 
 
266 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 
269 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
267 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.45 
 
 
270 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  43.28 
 
 
266 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  41.45 
 
 
266 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  43.91 
 
 
269 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  42.16 
 
 
271 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  42.49 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
274 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
267 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 
267 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
270 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 
268 aa  198  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 
270 aa  198  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
268 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 
270 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  43.07 
 
 
267 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 
284 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 
270 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
270 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 
271 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 
266 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  43.89 
 
 
257 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 
267 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 
268 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 
251 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 
266 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 
271 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 
261 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  42.26 
 
 
267 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 
268 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 
265 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 
267 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  42.75 
 
 
273 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 
267 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 
267 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 
264 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 
267 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  42.19 
 
 
255 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  41.54 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 
269 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  41.63 
 
 
244 aa  184  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.54 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  45.15 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
263 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  39.38 
 
 
259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
273 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 
267 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  39.49 
 
 
271 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 
273 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
276 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
266 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 
278 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  41.35 
 
 
268 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
270 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 
254 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  39.38 
 
 
252 aa  178  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  39.78 
 
 
269 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  47.26 
 
 
267 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  40.67 
 
 
268 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
267 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
270 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  37.77 
 
 
273 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  37.32 
 
 
273 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 
276 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 
276 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  42.08 
 
 
246 aa  175  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 
282 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  38.6 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  38.69 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>