More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0036 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  100 
 
 
299 aa  595  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  46.53 
 
 
299 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  38.03 
 
 
926 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  38.03 
 
 
923 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  37.68 
 
 
923 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  37.68 
 
 
926 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  37.68 
 
 
926 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  37.32 
 
 
917 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  37.68 
 
 
926 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  37.68 
 
 
926 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  37.68 
 
 
923 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.32 
 
 
912 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  43.13 
 
 
902 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.62 
 
 
872 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  43.16 
 
 
902 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  42.8 
 
 
902 aa  195  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  37.37 
 
 
905 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  36.97 
 
 
917 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  40.46 
 
 
937 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  36.79 
 
 
934 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  36.97 
 
 
917 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  41.74 
 
 
915 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.7 
 
 
951 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  39.66 
 
 
946 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  42.45 
 
 
888 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  37.24 
 
 
866 aa  192  5e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  36.62 
 
 
917 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.68 
 
 
928 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.91 
 
 
892 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  35.89 
 
 
917 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  35.89 
 
 
917 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  35.89 
 
 
917 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  43.18 
 
 
903 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.08 
 
 
940 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.41 
 
 
916 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  41.25 
 
 
913 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  41.67 
 
 
913 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  43.54 
 
 
480 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.79 
 
 
941 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  37.01 
 
 
937 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.01 
 
 
943 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  41.91 
 
 
911 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  38.55 
 
 
937 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  37.01 
 
 
937 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  38.55 
 
 
937 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  44.13 
 
 
910 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  35.82 
 
 
892 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  36.95 
 
 
941 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  38.89 
 
 
968 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.14 
 
 
891 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.08 
 
 
891 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.19 
 
 
939 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.61 
 
 
904 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  40 
 
 
928 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.43 
 
 
930 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  40.93 
 
 
482 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  39.11 
 
 
922 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.3 
 
 
946 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  42.11 
 
 
956 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  40.5 
 
 
988 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  38.17 
 
 
935 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  35.82 
 
 
892 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  38.43 
 
 
474 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.69 
 
 
939 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  36.49 
 
 
940 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  37.65 
 
 
474 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  38.13 
 
 
922 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  38.13 
 
 
922 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  38.13 
 
 
922 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  37.35 
 
 
976 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  41.08 
 
 
936 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.59 
 
 
896 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4612  DNA polymerase I  39.04 
 
 
930 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  42.79 
 
 
922 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  42.47 
 
 
1022 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  35.64 
 
 
979 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  37.28 
 
 
935 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  36.73 
 
 
942 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  37.74 
 
 
992 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  37.35 
 
 
978 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  32.79 
 
 
929 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.11 
 
 
921 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  39.11 
 
 
921 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.11 
 
 
921 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  39.11 
 
 
935 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  42 
 
 
945 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.29 
 
 
934 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  37.04 
 
 
885 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.32 
 
 
934 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  36.27 
 
 
850 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  37.35 
 
 
979 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.59 
 
 
896 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  37.54 
 
 
926 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.4 
 
 
930 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.22 
 
 
893 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  40.83 
 
 
855 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  36.64 
 
 
930 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  36.19 
 
 
978 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  40.09 
 
 
886 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  37.89 
 
 
829 aa  176  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>