122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0030 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
295 aa  591  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 
828 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
1060 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 
991 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.09 
 
 
782 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
1101 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 
985 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1313 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
714 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
1025 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1464  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.111167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.88 
 
 
725 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.3 
 
 
1009 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
343 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
923 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
1063 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.84 
 
 
2145 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.76 
 
 
689 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.64 
 
 
1162 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.74 
 
 
1266 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.28 
 
 
609 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 
809 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
1162 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
760 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
636 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2773  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
718 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 
957 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
438 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
949 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2382  photosystem I assembly protein Ycf3  30.47 
 
 
173 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1405  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028548  normal  0.280947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
1526 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  33.14 
 
 
695 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1261 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.54 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  24.86 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.52 
 
 
1550 aa  53.1  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.75 
 
 
1238 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0310  photosystem I assembly protein Ycf3  29.69 
 
 
187 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.42 
 
 
1404 aa  52.8  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 
758 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26511  photosystem I assembly protein Ycf3  29.31 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  20.95 
 
 
941 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.05 
 
 
1279 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
436 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  26.51 
 
 
844 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  29.38 
 
 
364 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  24.7 
 
 
919 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
842 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  22.82 
 
 
755 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.87 
 
 
650 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01461  photosystem I assembly protein Ycf3  32.29 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611815  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.18 
 
 
2413 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  25.25 
 
 
657 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0552  photosystem I assembly protein Ycf3  30.77 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.18 
 
 
1147 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.6 
 
 
577 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.28 
 
 
1468 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.56 
 
 
733 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  27.53 
 
 
421 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1498  photosystem I assembly protein Ycf3  38.64 
 
 
173 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 
1093 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
792 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 
1186 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  27.53 
 
 
421 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 
2240 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.32 
 
 
581 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.2 
 
 
560 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  22.53 
 
 
940 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
566 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  22.77 
 
 
775 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.09 
 
 
397 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02041  photosystem I assembly protein Ycf3  37.5 
 
 
173 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.564797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
587 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.12 
 
 
577 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2989  diguanylate cyclase  27.14 
 
 
628 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542118  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2153  photosystem I assembly protein Ycf3  33.7 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3996  photosystem I assembly protein Ycf3  37.93 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00079078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
1297 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2215  photosystem I assembly protein Ycf3  33.7 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.167684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3859  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  26.15 
 
 
631 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.97 
 
 
538 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.53 
 
 
837 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  21.43 
 
 
770 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  31.3 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  20.81 
 
 
603 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
562 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
409 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 
1020 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>