15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0025 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 97 aa  199  8e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.56 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0199  hypothetical protein  31.51 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 389 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  36.36 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  31.82 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4110  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222501  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4222  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 311 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>