270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0021 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  100 
 
 
70 aa  143  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  52.38 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  43.08 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45.45 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  43.55 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.88 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.88 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  44.83 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  37.88 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  35.94 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  48.28 
 
 
942 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  38.81 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  38.81 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.27 
 
 
954 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
889 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
818 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  36.67 
 
 
71 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  36.51 
 
 
69 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
67 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  42.19 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  34.92 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  40.62 
 
 
195 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.31 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
889 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  42.62 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
758 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  38.57 
 
 
810 aa  50.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  37.5 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  41.27 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
756 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
794 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  40.58 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2195  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
756 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  41.67 
 
 
1196 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
887 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  37.1 
 
 
345 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
723 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  35.82 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
890 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
724 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
723 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  34.33 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  36.07 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  35.48 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
837 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
826 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1143  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00252134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
91 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
91 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
694 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  33.87 
 
 
71 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  33.87 
 
 
833 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 
76 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
69 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
866 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
798 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
798 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  43.33 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
894 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
811 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  35 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.26 
 
 
826 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
802 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  35 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  35.94 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
811 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
925 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.03 
 
 
125 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  35.48 
 
 
109 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.87 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.26 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>