184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0014 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 379 aa  731    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  34.97 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  34.46 
 
 		 420 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  28.68 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  32.03 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  33.93 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 401 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  30.36 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  30.69 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  28.65 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  30.16 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 393 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  26.5 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.24 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  27.54 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.64 
 
 		 426 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  39.86 
 
 		 222 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  29.5 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  25.97 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>