More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0011 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0011  rare lipoprotein A  100 
 
 
161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000415587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
230 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
242 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
242 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
230 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  39.39 
 
 
261 aa  89.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  47.78 
 
 
202 aa  88.2  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
360 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  42.99 
 
 
202 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
360 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  49.35 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  58.11 
 
 
116 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  42.99 
 
 
213 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  47.67 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  37.7 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
124 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
371 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  41.74 
 
 
119 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  42.99 
 
 
213 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
124 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  42.99 
 
 
203 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
124 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  41.9 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  46.3 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  46.84 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  45.1 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  52.27 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  51.69 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  44.9 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  48.81 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  50.59 
 
 
274 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  42.06 
 
 
214 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  39.82 
 
 
270 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  50.59 
 
 
274 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  52.7 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  54.05 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  51.76 
 
 
324 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  53.01 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  44.79 
 
 
203 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  44.79 
 
 
203 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  45.78 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  43.64 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  44.12 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  51.22 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  35 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  52.44 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  44.9 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  38.26 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  48.86 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  40.21 
 
 
339 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  45.78 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  46.99 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.66 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  46.07 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  45.35 
 
 
279 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  45.35 
 
 
275 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  45.35 
 
 
275 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  50 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  44.32 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  45.35 
 
 
266 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  45 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  43.43 
 
 
367 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  42 
 
 
361 aa  77.4  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  42 
 
 
361 aa  77.4  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  49.4 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  42.7 
 
 
297 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  42.99 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  41.67 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  39.62 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  41.3 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  47.25 
 
 
121 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  47.13 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  44.68 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
318 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  45.88 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.76 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>