More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0003 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  100 
 
 		 116 aa  227  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 653 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 651 aa  123  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 628 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 672 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 690 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 662 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 629 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 629 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 663 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 632 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 634 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 634 aa  106  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 654 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 645 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 691 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 673 aa  103  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 642 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1936  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 728 aa  100  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 648 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 647 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 636 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 663 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 710 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 647 aa  99.4  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 664 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 688 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 663 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 628 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 670 aa  98.2  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 693 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 682 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 650 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 645 aa  97.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 642 aa  97.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 663 aa  97.1  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  55.29 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 650 aa  95.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 680 aa  94.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 663 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 660 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 699 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 628 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 653 aa  93.6  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 640 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 670 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 670 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.33 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 679 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 666 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 663 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 659 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 702 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 734 aa  90.5  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 654 aa  90.5  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 628 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 731 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 628 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 657 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 648 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 657 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.16 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 636 aa  88.2  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 711 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 644 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 698 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.74 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 671 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 665 aa  87.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 702 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 669 aa  86.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 656 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 704 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 702 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 705 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 726 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.81 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 655 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 680 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 710 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 664 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2449  methionyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 694 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0120068  normal  0.754199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 670 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 		 711 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 638 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2642  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 694 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 694 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 689 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 694 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 667 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>