29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1643 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1643  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  522  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.64306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0203  putative esterase  50.41 
 
 
249 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0876  putative esterase  43.67 
 
 
245 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.942655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4768  hypothetical protein  36.32 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2618  putative esterase  36.86 
 
 
239 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1799  putative esterase  36.44 
 
 
239 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.938464  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3264  putative esterase  36.86 
 
 
248 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678307  hitchhiker  0.000491614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4003  putative esterase  34.91 
 
 
239 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0438  putative esterase  32.39 
 
 
237 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0053  putative esterase  36.6 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177821  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2519  putative esterase  30.96 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.923946  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1340  putative esterase  34.15 
 
 
234 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.524474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2122  hypothetical protein  33.19 
 
 
242 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1747  hypothetical protein  34.06 
 
 
242 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.672551  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0307  putative esterase  31.38 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.268113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0220  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5938  putative esterase  32.07 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2168  hypothetical protein  28.45 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2439  hypothetical protein  31.22 
 
 
242 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3320  esterase-like protein  26.49 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494197  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  23.87 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  26.13 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  26.69 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  29.08 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  38.81 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  39.29 
 
 
478 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0210  putative esterase  21.11 
 
 
475 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2510  S-formylglutathione hydrolase  25 
 
 
273 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3007  putative esterase  30.4 
 
 
397 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>