More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1580 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 505 aa  1022    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.28 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  48.28 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.9 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.17 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.97 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.56 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  48.69 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.56 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 515 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.56 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.39 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  48.79 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.26 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.68 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.86 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  45.12 
 
 		 521 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  46.44 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.77 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.95 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  45.33 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 504 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  44.11 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  44.15 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.8 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.58 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  44.62 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  44.15 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  44.91 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.51 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 		 506 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.8 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  45.01 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.48 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.85 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  44.27 
 
 		 514 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.69 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  43.69 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.58 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  44.31 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.42 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.23 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 506 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 506 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  43.89 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 506 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.49 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.99 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.88 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  44.31 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.23 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  41.72 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.34 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.65 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.97 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.94 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.39 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.11 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.31 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.11 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.11 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>