241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1570 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  100 
 
 
487 aa  978    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  47.84 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  46.61 
 
 
483 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  53.48 
 
 
485 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  53.28 
 
 
485 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  50.92 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  51.13 
 
 
483 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  51.43 
 
 
485 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  53.18 
 
 
485 aa  448  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  49.49 
 
 
485 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  50.51 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  49.08 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  50.72 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  50.92 
 
 
483 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  50.72 
 
 
483 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  48.87 
 
 
485 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  50.51 
 
 
483 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  50.53 
 
 
485 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  49.19 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  49.49 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  50.85 
 
 
486 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  48.47 
 
 
483 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  50.92 
 
 
483 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  50.92 
 
 
483 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  50.72 
 
 
483 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  51.13 
 
 
483 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  49.26 
 
 
485 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  49.47 
 
 
485 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  48.87 
 
 
485 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  49.26 
 
 
485 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  50.41 
 
 
488 aa  435  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  48.58 
 
 
483 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  48.98 
 
 
485 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  45.27 
 
 
483 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  46.09 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  46.01 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  44.88 
 
 
483 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  45.81 
 
 
482 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  45.17 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  43.56 
 
 
481 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  43.94 
 
 
484 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  40.85 
 
 
483 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  36.81 
 
 
486 aa  338  9e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.69 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  38.07 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.73 
 
 
488 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.21 
 
 
498 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  36.38 
 
 
486 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  36.38 
 
 
485 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.96 
 
 
485 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  38.36 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  36.81 
 
 
488 aa  309  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  36.68 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  36.61 
 
 
488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  36.8 
 
 
474 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.97 
 
 
485 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  36.05 
 
 
479 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.76 
 
 
481 aa  299  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  40.75 
 
 
484 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.49 
 
 
478 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.59 
 
 
466 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  36.02 
 
 
479 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  35.03 
 
 
485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.8 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.21 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.93 
 
 
485 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  33.47 
 
 
481 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  36.38 
 
 
477 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  32.45 
 
 
480 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  35.67 
 
 
482 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  35.1 
 
 
481 aa  263  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.34 
 
 
487 aa  261  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  34.97 
 
 
476 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  34.16 
 
 
485 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  34.1 
 
 
484 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  31.9 
 
 
481 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  31.85 
 
 
481 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  34.71 
 
 
483 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.17 
 
 
483 aa  256  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  33.68 
 
 
484 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  33.89 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  35.9 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  34.48 
 
 
484 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.61 
 
 
478 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>