109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1470 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03568  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0019  YidE/YbjL duplication  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1470  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1100    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0186692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0015  hypothetical protein  64.36 
 
 
553 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4141  hypothetical protein  66.06 
 
 
552 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3896  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4191  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0050  hypothetical protein  65.34 
 
 
552 aa  700    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.259185 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3793  hypothetical protein  66.06 
 
 
552 aa  713    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212534  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0013  hypothetical protein  66.06 
 
 
552 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0018  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4048  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.926821  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4236  hypothetical protein  63.52 
 
 
553 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4089  hypothetical protein  64.55 
 
 
553 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4138  hypothetical protein  64.55 
 
 
553 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4017  hypothetical protein  64.55 
 
 
553 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.837569  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4034  hypothetical protein  64.55 
 
 
553 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4196  hypothetical protein  64.55 
 
 
553 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5115  hypothetical protein  63.7 
 
 
561 aa  700    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44003 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03512  hypothetical protein  63.7 
 
 
553 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0036  hypothetical protein  65.52 
 
 
552 aa  701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0042  hypothetical protein  65.7 
 
 
552 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1568  YidE/YbjL duplication  43.84 
 
 
559 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1411  hypothetical protein  42.73 
 
 
561 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.540338 
 
 
-
 
NC_002950  PG0562  hypothetical protein  34.59 
 
 
558 aa  313  5.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0607  YidE/YbjL duplication  34.02 
 
 
541 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617712  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1016  Trk family potassium uptake protein  31.88 
 
 
546 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0018  YidE/YbjL duplication  29.78 
 
 
529 aa  249  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0175151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2711  YidE/YbjL duplication  31.23 
 
 
549 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129476  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1848  YidE/YbjL duplication  32.38 
 
 
545 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2550  TrkA-C:YidE/YbjL duplication  32.24 
 
 
546 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172993  hitchhiker  0.00000000000069423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3636  YidE/YbjL duplication  30.64 
 
 
546 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1965  YidE/YbjL duplication  30.64 
 
 
549 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103303  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0870  YidE/YbjL duplication  29.76 
 
 
534 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2318  YidE/YbjL like transporter  29.41 
 
 
544 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2351  YidE/YbjL duplication  30.68 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000718232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1552  YidE/YbjL duplication  29.03 
 
 
544 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0856  YidE/YbjL duplication  31.37 
 
 
537 aa  200  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.682157  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1553  YidE/YbjL duplication  27.54 
 
 
529 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1476  YidE/YbjL duplication  28.55 
 
 
530 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2470  YidE/YbjL duplication  26.82 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00004763  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0891  YidE/YbjL duplication  27.09 
 
 
533 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0037  YidE/YbjL duplication  27.4 
 
 
531 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1280  YidE/YbjL duplication  27.22 
 
 
531 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2649  hypothetical protein  24.24 
 
 
562 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1559  hypothetical protein  24.24 
 
 
562 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2734  hypothetical protein  24.24 
 
 
562 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3938  YidE/YbjL duplication  26.7 
 
 
559 aa  147  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4141  YidE/YbjL duplication  26.9 
 
 
530 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3956  YidE/YbjL duplication  28.12 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01390  predicted permease  28.7 
 
 
522 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1952  hypothetical protein  24.16 
 
 
562 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00456321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1362  hypothetical protein  23.23 
 
 
561 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1686  hypothetical protein  23.98 
 
 
562 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0560693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0919  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0975  hypothetical protein  23.46 
 
 
561 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00852  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2795  YidE/YbjL duplication  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0950  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2749  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0874  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938397  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2485  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1001  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588292  normal  0.272604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17890  YidE/YbjL duplication  26.33 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.286246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00858  hypothetical protein  22.7 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1639  hypothetical protein  23.71 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0943  hypothetical protein  23.9 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1004  hypothetical protein  23.9 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492051  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1023  hypothetical protein  23.9 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0907  hypothetical protein  23.9 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1586  YidE/YbjL duplication  25.04 
 
 
563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2029  hypothetical protein  25.58 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0129834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02636  hypothetical protein  24.51 
 
 
560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0715  hypothetical protein  24.87 
 
 
558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2393  hypothetical protein  22.58 
 
 
562 aa  127  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003763  TrkA Potassium channel-family protein  25.38 
 
 
511 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000044665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3045  YidE/YbjL duplication  24.53 
 
 
560 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2293  hypothetical protein  23.71 
 
 
562 aa  126  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1851  YidE/YbjL duplication  26.03 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0417927  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2143  hypothetical protein  22.48 
 
 
562 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3841  YidE/YbjL duplication  24.74 
 
 
565 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4847  putative transporter  24.68 
 
 
567 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0674099  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0482  YidE/YbjL duplication  25.23 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1985  YidE/YbjL duplication  23.03 
 
 
561 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0595755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2708  YidE/YbjL duplication  25.18 
 
 
561 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2707  YidE/YbjL duplication  24.77 
 
 
564 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3892  aspartate/alanine exchanger family protein  24.76 
 
 
560 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3839  YidE/YbjL duplication  24 
 
 
562 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0788  YidE/YbjL duplication  24.78 
 
 
560 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.442707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2952  YidE/YbjL duplication  23.67 
 
 
579 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03065  hypothetical protein  23.35 
 
 
575 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0096  YidE/YbjL duplication  25.04 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0519277  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3913  YidE/YbjL domain-containing protein  24.83 
 
 
589 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0230126  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3482  YidE/YbjL duplication  24.02 
 
 
563 aa  94.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4738  YidE/YbjL duplication  22.83 
 
 
581 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0789  YidE/YbjL duplication  24.31 
 
 
560 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3893  aspartate/alanine exchanger family protein  24.06 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1198  probable membrane permease  22.84 
 
 
625 aa  78.2  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0281  YidE/YbjL duplication  22.78 
 
 
549 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00426862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0300  YidE/YbjL duplication  28.19 
 
 
384 aa  65.1  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>